恶性葡萄胎经过治疗，一般预后良好，但以后仍有复发及发展成绒毛膜癌的可能，因此仍应劝告避孕至少2年，还需定期随访。

多数在葡萄胎清除后6个月内发生，但亦有葡萄胎未排出之前就发生恶变者。恶性葡萄胎虽具有恶性肿瘤特点，但治疗效果及预后均较绒毛膜癌为好。